I Corsi di Laurea magistrale sono organizzati in tre percorsi di studio (Classi di Laurea) secondo le indicazioni del Decreto Ministeriale 270/2004: Laurea Magistrale interclasse in Ingegneria Strutturale e Edile (Classi LM-24 e LM-23) e Laurea Magistrale in Ingegneria delle Infrastrutture Civili e dell'Ambiente.

Il conseguimento della Laurea magistrale presuppone il superamento di 120 CFU, articolati in due anni accademici, fra questi in particolare: 3 CFU riguardano un Tirocinio o altra attività applicativa (fra cui eventualmente Ulteriori conoscenze linguistiche, p.e. Lingua Inglese Livello B2 o superiore) e la Prova finale per 18 CFU nella Laurea Magistrale in Ingegneria Strutturale e Edile e per 15 CFU nella Laurea Magistrale in Ingegneria delle Infrastrutture Civili e dell'Ambiente.